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三井情報とNTTドコモビジネスは2026年10月5日、全国5拠点に分散配置したGPUを使ったゲノム解析の共同実証を実施したと発表した。両社によると、研究用途を想定した3種類の解析で、処理時間は1拠点で実行した場合の25～29%になった。
計算資源・電力の制約に対応する分散構成
両社は、ゲノムデータの増加に伴う計算資源不足や、単一データセンターの収容能力・電力容量の制約を課題に挙げている。実証では、離れたGPUをIOWN APNで接続する「GPU over APN Testbed」に、三井情報のワークロード最適化技術と高速検索技術を組み合わせた。
首都圏のストレージに解析データを格納し、札幌から福岡までの5拠点で分散解析した。高速検索技術はHeteroDBのPG-Stromを基に三井情報が独自開発した。Testbedは2026年7月に提供を開始した全国8拠点の実証環境で、両社は今回を同環境で初の実証実験としている。
解析にはIGSRが公開する3,202人分、約170億レコード・約5TBのVCF形式データを使用。染色体領域の変異検索、疾患リスクに関連する遺伝型の検体数集計、220種類のがんドライバー変異の検索を行った。
3種類の解析で処理時間を比較
1拠点と5拠点での処理時間は、染色体領域の変異検索が134.4秒から33.5秒、疾患関連遺伝型の集計が99.9秒から28.6秒、がんドライバー変異の検索が102.3秒から28.9秒となった。1拠点に対する比率は順に25%、29%、28%で、今回の構成と3種類の解析で得られた結果だ。
三井情報は検索・最適化技術の研究開発を継続する。NTTドコモビジネスは分散計算の知見をGPUaaSなどへ活用し、両社は分散GPU技術の実用化に向けた知見を蓄積する方針だ。
